Το σύστημα ελέγχου του ρομπότ παλετοποίησης περιλαμβάνει κυρίως σύστημα ελέγχου λογισμικού και σύστημα ελέγχου υλικού. Στο σχεδιασμό του σύγχρονου συστήματος ρομπότ παλετοποίησης, το σύστημα ελέγχου υλικού υιοθετεί ως επί το πλείστον τη μορφή σπονδυλοποίησης και η συνολική δομή υιοθετεί τη δομή κατανεμημένου ελέγχου.
Ο επάνω υπολογιστής χρησιμοποιεί συνηθισμένο υπολογιστή βιομηχανικού ελέγχου, ο οποίος ασχολείται κυρίως με την παρακολούθηση και τη διαχείριση λειτουργίας του συστήματος, όπως έλεγχος κιβωτίων διδασκαλίας, υπηρεσία απεικόνισης, μετασχηματισμός συντεταγμένων, αυτόματη επιτάχυνση και υπολογισμός επιβράδυνσης κ.λπ. Σύμφωνα με την απαίτηση της εντολής του χρήστη και δηλώσεις προγράμματος δράσης για σχεδιασμό τροχιάς, αλγόριθμο παρεμβολής και μετασχηματισμό συντεταγμένων, η θέση του κινητήρα υπολογίζεται για κάθε άξονα και λαμβάνει σύμφωνα με το επόμενο επίπεδο σήματος ανάδρασης και σήματος αισθητήρα, την εκτέλεση της εργασίας κρίσης και την περιβαλλοντική κατάσταση και στη συνέχεια προς τα κάτω επίπεδο κάθε θέσης άρθρωσης σερβοσύστημα μεταδίδει ένα και τιμές σημείου ρύθμισης της αντίστοιχης ενημέρωσης θέσης, Για να πραγματοποιήσει το συντονισμό και τον έλεγχο της κίνησης κάθε άρθρωσης.
Κάτω από ένα μηχάνημα που υιοθετεί ελεγκτή DSP και προγραμματιζόμενο λογικό ελεγκτή PLC, ο ελεγκτής DSP υιοθετείται από τις ΚΑΡΤΕΣ ελέγχου κίνησης PMAC104, κυρίως για την εκτέλεση υπολογισμών κινηματικής σε πραγματικό χρόνο, σχεδιασμού τροχιάς, υπολογισμού παρεμβολής, ελέγχου σερβομηχανισμού κ.λπ., ανάγνωσης συνεχώς κάθε παλμού κωδικοποιητή άξονα ποσότητα, υπολογισμός της τρέχουσας θέσης του ρομπότ και η μέθοδος λογισμικού συγκρίνεται με μια δεδομένη θέση. η παρακολούθηση διάφορων γύρω μεταφορέων κ.λπ.